En teoría no van iguales; un led rojo tiene un GAP de 1.5 V, más o menos, mientras que el voltaje al que conmuta uno azul es de unos 4 voltios. Sin embargo, un led no es exactamente un diodo, que o conduce o no, sino que se puede regular la intensidad de la luz que emite.
Así que, por ejemplo, con una resistencia de 470 ohmios y el led en serie, con el rojo se tiene una corriente de unos 22 miliamperio, mientras que con el azul, la corriente que lo atraviesa es de 17 mA. Por eso los leds que normalmente se ponen son "súper-luminosos", que con poquita corriente tienen una muy alta capacidad lumínica.
Vamos, que lo único que le va a pasar al circuito es que va a pasar menos corriente a través de él, pero, por ejemplo, yo en el coche sustituí los leds naranjas (de similar comportamiento al de los rojos) por unos súper-azules, y ningún problema, así que tampoco se va a joder nada.
Si quisieses igualar las corrientes a las que pasaban antes, se podría cambiar la resistencia, pero, como digo, no es necesario -o al menos no debería serlo-.
Un saludo, y, de nuevo, espero no cagarla.