No se si esto te puede ayudar, pero yo tenia una hercules dj console rmx conectada a dos akiyama dj 2000 y m pasaba lo mismo, hazlo a ver si te va:
1. Vete a configuracion del virtual dj
2. En la primera pestaña que te aparece ("Sound Setup") localiza la casilla "Apply EQ on external imputs" y activala.
3. Dale a aceptar y listo

espero haberte ayudado
Un saludo!
por cierto, en la mesa de mezclas debes de tener un boton para activar el plato, en mi hercules se llamaba "Source 1 o Source 2" y para que te rule el plato (osea para que manejes el plato y no el virtual deck del virtual dj tienes que activar alguna opcion de la mesa de mezclas porque sino lo que estas controlando es la ecualizacion de el mp3 que hayas cargado en el virtual dj)